首先需要取消“站点属性/允许匿名连接”，如图1。
接着进入“计算机管理/本地用户和组”，新建立一个组，这里建立为FTPuser，然后新建立一个用户FTP01，然后修改FTP01的属性，把它加入FTPuser组，去掉系统默认的users组。在NTFS格式分区下(这里为d盘)创建文件夹FTP01和FTP02，然后设置安全权限，如图2。
同样设置文件夹FTP02的权限为FTP02完全控制，当然这里可以按照实际情况分配不同用户不同的权限。回到IIS管理器，选择一个FTP站点“新建/虚拟目录/下一步”在别名处输入FTP01，选择“下一步”，路径选择刚刚创建的FTP01目录，选择“下一步”，同样新建一个虚拟目录FTP02，路径指向FTP02目录。这里注意的是：别名和目录名以及用户名3个必须完全一致。
测试一下：这里以IP为192.168.0.16为例，输入FTP://192.168.0.16，回车，提示输入用户和密码，输入FTP01及其密码，顺利进入，这时进入的只能是FTP01虚拟目录，可以上传一个文件，然后在服务器上查看一下是放置在哪个目录下就可判定了。同样，以FTP02登入，就进入了FTP02目录，用户被限制在自己的目录内不能进入他人目录，安全性还是有保障。如果用户需要能自己更改密码，则只需要在创建用户的时候，不选中图3所示的选项即可。
小提示：
客户端修改FTP账户密码的方法：
在命令提示符下输入：
FTP 192.168.0.16
输入用户名
输入密码
输入quote “site pswd 旧密码新密码”
本方法优点：结合NTFS权限以及磁盘限额能很好地实现多用户的多样化管理。
本方法缺点：由于FTP用户密码是以明文的方式在网络上传输，所以不太安全，遗憾的是，IIS内置的FTP服务并不支持SSL，这一点比不上Serv-U。